ความแตกต่างที่สำคัญ: อะตอมเป็นหน่วยพื้นฐานที่สสารทั้งหมดสร้างขึ้น อะตอมของธาตุต่าง ๆ มารวมตัวกันเพื่อสร้างโมเลกุล สิ่งนี้เกิดขึ้นผ่านปฏิกิริยาทางเคมี โมเลกุลเป็นสารเคมีที่มีอยู่น้อยที่สุด โดยพื้นฐานแล้วสารประกอบคือโมเลกุลชนิดหนึ่ง โมเลกุลสามารถประกอบด้วยอะตอมตั้งแต่สองอะตอมขึ้นไปที่มีองค์ประกอบเดียวกันหรือสองอะตอมขึ้นไปที่มีองค์ประกอบต่างกัน อย่างไรก็ตามสารประกอบเป็นโมเลกุลที่ประกอบด้วยอะตอมของโมเลกุลที่แตกต่างกัน
องค์ประกอบคือสารเคมีบริสุทธิ์ที่มีอะตอมหนึ่งหรือหนึ่งชนิดซึ่งแตกต่างกันตามเลขอะตอม เลขอะตอมนั้นได้มาจากจำนวนของโปรตอนที่มีอยู่ในนิวเคลียสของธาตุ มีองค์ประกอบทั้งหมด 118 รายการที่ได้รับการจำแนกแบ่งระหว่างโลหะเมทัลรอยด์และอโลหะ แต่ละองค์ประกอบมีชุดคุณสมบัติของตนเอง องค์ประกอบส่วนใหญ่มีอยู่บนโลกในขณะที่บางส่วนได้รับการพัฒนาโดยใช้ปฏิกิริยานิวเคลียร์ องค์ประกอบอยู่ในรูปแบบ rawest แล้วและไม่สามารถแยกย่อยได้อีก องค์ประกอบทั้งหมดสามารถพบได้ในตารางธาตุซึ่งแสดงรายการตามเลขอะตอม
อะตอมของธาตุต่าง ๆ มารวมตัวกันเพื่อสร้างโมเลกุล สิ่งนี้เกิดขึ้นผ่านปฏิกิริยาทางเคมี ตัวอย่างเช่นอะตอมไฮโดรเจนสองอะตอมและออกซิเจนหนึ่งอะตอมรวมกันเพื่อสร้างโมเลกุลของน้ำ
โมเลกุลเป็นสารเคมีที่มีอยู่น้อยที่สุด เช่นน้ำที่มีปริมาณน้อยที่สุดที่สามารถมีได้คือโมเลกุลของน้ำหรือ H20 มันประกอบด้วยอะตอมที่แตกต่างกัน ดังนั้นมันสามารถแยกกลับเข้าไปในอะตอมที่แตกต่างกัน
โมเลกุลสามารถมีคุณสมบัติแตกต่างกันมากจากองค์ประกอบที่ทำจาก ตัวอย่างเช่น: น้ำมีพฤติกรรมแตกต่างจากออกซิเจนหรือไฮโดรเจนอย่างมากแม้ว่าจะประกอบด้วยอะตอมไฮโดรเจนสองอะตอมและออกซิเจนหนึ่งอะตอม
นอกจากนี้อะตอมไม่สามารถดำรงอยู่ได้อย่างเป็นอิสระในธรรมชาติโดยไม่ต้องผูกมัดกับบางสิ่ง เราจะไม่พบเพียงอะตอมออกซิเจนเดียวหรืออะตอมคาร์บอนเดียว มันมักจะถูกผูกมัดกับบางสิ่งบางอย่างเช่น O2 (ออกซิเจน) หรือ CO2 (คาร์บอนไดออกไซด์) เมื่อถูกผูกเข้ากับโมเลกุลโมเลกุลนั้นสามารถดำรงอยู่ได้โดยอิสระในธรรมชาติซึ่งเป็นสาเหตุที่ทำให้เราสามารถค้นหาโมเลกุลของออกซิเจนโมเลกุลของคาร์บอนไดออกไซด์โมเลกุลของน้ำ (H2O) เป็นต้น
โมเลกุลมักจะรวมตัวกันเป็นกลุ่มการก่อตัวขึ้นอยู่กับสถานะของพวกเขา เช่นในสถานะก๊าซโมเลกุลมีแนวโน้มที่จะบินไปรอบ ๆ ในสถานะของเหลวโมเลกุลมีแนวโน้มที่จะรวมตัวกันอย่างหลวม ๆ เพื่อให้พวกเขายังคงเคลื่อนไหวได้ ในขณะที่อยู่ในสถานะของแข็งโมเลกุลจะถูกอัดแน่นเข้าด้วยกันและสามารถสั่นสะเทือนได้เท่านั้น
โมเลกุลมักจะแสดงในสูตรโมเลกุล ตัวอย่างเช่น: O2, H2O, CO2, C6H12O6 (น้ำตาล) สูตรโมเลกุลคือชื่อขององค์ประกอบตามด้วยจำนวนอะตอมขององค์ประกอบนั้นในโมเลกุล
โดยพื้นฐานแล้วสารประกอบคือโมเลกุลชนิดหนึ่ง โมเลกุลสามารถประกอบด้วยอะตอมตั้งแต่สองอะตอมขึ้นไปที่มีองค์ประกอบเดียวกันหรือสองอะตอมขึ้นไปที่มีองค์ประกอบต่างกัน อย่างไรก็ตามสารประกอบเป็นโมเลกุลที่ประกอบด้วยอะตอมขององค์ประกอบต่าง ๆ ดังนั้นจึงอาจกล่าวได้ว่าสารประกอบทั้งหมดเป็นโมเลกุล แต่ไม่ใช่โมเลกุลทั้งหมดที่เป็นสารประกอบ
ดังนั้นไฮโดรเจน (H2), ออกซิเจน (O2), ไนโตรเจน (N2), น้ำ (H2O), คาร์บอนไดออกไซด์ (CO2) และมีเทน (CH4) เป็นโมเลกุลทั้งหมด อย่างไรก็ตามมีเพียงน้ำ (H2O) คาร์บอนไดออกไซด์ (CO2) และมีเธน (CH4) เท่านั้นที่เป็นสารประกอบ
