ความแตกต่างหลัก: โกโก้และโกโก้มีความคล้ายคลึงกันเพราะทั้งคู่มีประวัติเหมือนกัน ข้อตกลงโกโก้และโกโก้เดิมเปลี่ยนได้; อย่างไรก็ตามวันนี้มีการใช้ที่แตกต่างกัน โกโก้ใช้เพื่ออ้างถึงถั่วคั่วและแปรรูปซึ่งใช้ในการสร้างผงโกโก้และช็อคโกแลต ต้นโกโก้ถูกใช้เพื่ออ้างถึงถั่วที่ยังไม่ผ่านกระบวนการซึ่งจะเอาเนยโกโก้ออกจากเมล็ดและรักษาสารอาหารของถั่วไว้
คำว่า 'โกโก้' และ 'โกโก้' นั้นคล้ายกันจริง ๆ เพราะทั้งคู่อ้างถึงต้นไม้เดียวกันกับที่ผลิตโกโก้หรือเมล็ดโกโก้ เพื่อให้เข้าใจสิ่งนี้เราจะต้องย้อนกลับไปยังประวัติศาสตร์ของถั่วเหล่านี้ ทุกอย่างเริ่มต้นด้วย Theobroma Cacao ต้น Theobroma Cacao เป็นต้นไม้เขียวชอุ่มขนาดเล็กที่เป็นส่วนหนึ่งของพืช Malvaceae และมีถิ่นกำเนิดในอเมริกาใต้ ช็อคโกแลตและผลิตภัณฑ์ที่คล้ายคลึงกันอื่น ๆ มีอายุย้อนหลังไปหลายศตวรรษซึ่ง แต่เดิมถือว่าเป็น 'อาหารของพระเจ้า' ชื่อของต้นไม้นั้นเป็นชื่อสามัญที่ได้มาจากคำภาษากรีก 'theos' และ 'broma' ซึ่งสามารถแปลเป็น 'พระเจ้า' และ 'อาหาร' อย่างคร่าวๆตามลำดับ คำว่า 'ต้นโกโก้' นั้นได้มาจากชื่อพื้นเมืองของพืชในภาษา Mesoamerican เนื่องจากความนิยมและความสำคัญถั่วเหล่านี้จึงถูกใช้เป็นสกุลเงิน
ต้นโกโก้มีความสัมพันธ์กับคน Olmec ซึ่งเป็นถิ่นกำเนิดของเม็กซิโก จะถือว่าเป็นการออกเสียงที่ใกล้เคียงที่สุดกับชื่อดั้งเดิมของพืช เมื่อเวลาผ่านไปการผลิตต้นโกโก้นี้ก็ถูกส่งต่อไปยังชาวมายันและชาวสเปน เป็นที่น่าสนใจที่จะทราบว่าในหลาย ๆ วัฒนธรรมคำว่าโกโก้ยังคงใช้เพื่ออ้างถึงต้นโกโก้เมล็ดโกโก้และผงโกโก้ ตอนนี้คำว่า 'โกโก้' เชื่อว่าเป็นคำแปลคร่าวๆหรือการสะกดผิดที่ติดอยู่ ในประเทศที่ใช้ภาษาอังกฤษคำศัพท์ดังกล่าวได้รับความนิยมอย่างแพร่หลายมากกว่าคำศัพท์ดั้งเดิมและยังคงมีการใช้กันอย่างแพร่หลาย ดังนั้นตามคำนี้โกโก้และโกโก้จึงพูดถึงสิ่งเดียวกัน ไม่มีความแตกต่างระหว่างคำมากกว่าการสะกดของมัน
ตอนนี้คำว่าโกโก้ถูกสงวนไว้ให้ใช้เป็นต้นโกโก้ดั้งเดิม, ต้นโกโก้และถั่วโกโก้บดละเอียดที่รู้จักกันในชื่อผงโกโก้ เมล็ดต้นโกโก้รักษาสารอาหารและแร่ธาตุที่สำคัญในขณะเดียวกันก็เอาเนยโกโก้ที่ไม่แข็งแรงออกไปด้วยกระบวนการบีบเย็นซึ่งจะทำการกำจัดเนยออกเท่านั้นซึ่งจะทำให้ผงโกโก้ผงนั้นมีคุณสมบัติ เมล็ดโกโก้ถูกใช้เพื่ออ้างถึงถั่วที่ผ่านการอบแล้วซึ่งนำสารอาหารและแร่ธาตุที่จำเป็นออกมาและยังคงมีเนยอยู่มาก โกโก้ถือว่าไม่ดีต่อสุขภาพและขุนในขณะที่โกโก้เป็นตัวแปรสุขภาพมาก ต้นโกโก้ยังแทนที่ผงโกโก้ในขนมอบและยังมีช็อคโกแลตที่ขายโดยใช้เงื่อนไขต้นโกโก้มากกว่าโกโก้