ความแตกต่างที่สำคัญ: มวลอะตอมเป็นเพียงมวลของไอโซโทปเฉพาะหรือมวลรวมของโปรตอนนิวตรอนและอิเล็กตรอนของอะตอม Atomic number คือจำนวนของโปรตอนที่พบในนิวเคลียสขององค์ประกอบ
ให้หน้ามันเคมีสับสนองค์ประกอบต่าง ๆ หมายเลขอะตอมพันธบัตรมวลน้ำหนักอะตอม ฯลฯ คำทั้งหมดเหล่านี้เริ่มเบลอหลังจากระยะเวลาหนึ่งที่บุคคลไม่สามารถแยกความแตกต่างจากอีก มวลอะตอมและเลขอะตอมเป็นคำสองคำที่มักสับสนและใช้แทนกันได้

มวลอะตอมคือมวลของอะตอมเมื่อเหลือ เนื่องจากเมื่ออะตอมเคลื่อนที่ด้วยความเร็วสูงมากมันก็จะมีมวลเพิ่มขึ้น แม้ว่าตามคำจำกัดความแล้วมวลอะตอมก็คือมวลของโปรตอนนิวตรอนและอิเล็กตรอนทั้งหมดอิเล็กตรอนมีขนาดเล็กเกินไปที่จะสร้างความแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญในมวลอะตอม องค์ประกอบส่วนใหญ่ในตารางธาตุมีไอโซโทปและเนื่องจากความแตกต่างในการนับนิวตรอนมวลของไอโซโทปแต่ละชนิดก็เปลี่ยนไปเช่นกัน
มวลอะตอมจะแสดงโดยใช้หน่วยมวลอะตอมหรืออามู หนึ่งหน่วยมวลอะตอมเท่ากับ 1 ใน 12 ของมวลของ Carbon-12 เมื่อมวลของอะตอมถูกหารด้วย 1 ใน 12 ของมวลของ Carbon-12 จะได้รับมวลสัมพัทธ์ขององค์ประกอบ อย่างไรก็ตามมวลสัมพัทธ์ของวัตถุเป็นน้ำหนักอะตอมขององค์ประกอบตามที่คำนวณโดยพิจารณาจากไอโซโทปทั้งหมด แม้ว่าจะไม่ถือว่าเป็นมวลอะตอมขององค์ประกอบ

Atomic number คือจำนวนของโปรตอนที่พบในนิวเคลียสขององค์ประกอบ เมื่ออะตอมเป็นกลางก็หมายความว่ามันมีจำนวนโปรตอนและอิเล็กตรอนเท่ากัน หมายเลขอะตอมถูกแทนด้วย Z เนื่องจากแต่ละองค์ประกอบมีจำนวนโปรตอนที่แตกต่างกันหมายเลขนี้ยังใช้เพื่อแสดงองค์ประกอบ ไอโซโทปมักจะมีเลขอะตอมเท่ากัน แต่จะจำแนกโดยใช้มวลอะตอมของพวกมันตัวอย่างเช่น Carbon-12, Carbon-13
องค์ประกอบจะถูกจัดเรียงตามหมายเลขอะตอมในตารางธาตุ หมายเลขอะตอมแสดงอยู่ที่มุมบนซ้ายขององค์ประกอบเป็นตัวยก หมายเลขอะตอมสามารถช่วยเปิดเผยข้อมูลเกี่ยวกับองค์ประกอบและหลายคนสามารถดูหมายเลขอะตอมและระบุว่าองค์ประกอบนั้นคืออะไร มันยังบอกตำแหน่งของตารางธาตุที่สามารถวางและไม่ว่าจะเป็นของเหลวก๊าซหรือของแข็ง หมายเลขอะตอมยังให้ข้อมูลเกี่ยวกับประจุนิวเคลียสสถานะออกซิเดชันพฤติกรรมพันธะประจุไอออน ฯลฯ